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本文標(biāo)題:"光學(xué)儀器常識(shí)-怎樣使用顯微鏡拍攝細(xì)胞"

新聞來(lái)源:未知 發(fā)布時(shí)間:2013-5-13 17:07:41 本站主頁(yè)地址:http://www.y7853.cn

光學(xué)儀器常識(shí)-怎樣使用顯微鏡拍攝細(xì)胞

影像類別分類

每張顯微影像因?yàn)榧?xì)胞組織與背景的比例不同,整張影像的色彩分布就會(huì)不一樣。
當(dāng)影像中細(xì)胞組織與背景的分布比例相同時(shí),后續(xù)欲進(jìn)行之色彩正規(guī)化才有其效果,否則會(huì)因?yàn)樯什町愡^(guò)大,
而失去了不同類型影像所應(yīng)有的色彩分布。因此我們必須先對(duì)影像做分類,以利于后續(xù)進(jìn)行色彩正規(guī)化時(shí),
能適當(dāng)?shù)拿枋錾史植肌?/div>

在這個(gè)步驟我們會(huì)利用影像的亮度標(biāo)準(zhǔn)差,
將影像區(qū)分為三大類:

第一類為乾淨(jìng)影像類型(影像大部分為背景)、

第二類為稍微複雜影像類型(影像包含部分細(xì)胞與組織)

第三類為複雜影像類型(影像大部分為組織,背景只占小部分)。




去除亮背景
從影像上可以發(fā)現(xiàn),每張顯微影像當(dāng)中,若是有細(xì)胞組織的地方,其亮度值會(huì)比較低且偏暗;
反之在無(wú)其他細(xì)胞組織的地方,其亮度值比較高且偏亮,因此我們將其稱為亮背景。亮背景在影像中佔(zhàn)了蠻大的比例,因此如果能先將這些亮背景去除,則可以減少背景的影響,更能有效率的針對(duì)剩馀細(xì)胞組織來(lái)偵測(cè)結(jié)核菌。

去除亮背景的閥值,當(dāng)亮度值超過(guò)這個(gè)閥值,則屬于亮背景,欲將其去除,反之為細(xì)胞組織而欲將其保留。
max_Intensity為影像亮度分布中出現(xiàn)最多次數(shù)的亮度值,k值為經(jīng)驗(yàn)值,于每一類所使用的k值皆不太相同,
std為影像亮度標(biāo)準(zhǔn)差。

結(jié)核菌候選區(qū)域偵測(cè)
經(jīng)過(guò)前面的影像前處理之后,我們已經(jīng)將可能包含結(jié)核菌的組織分割出來(lái),因此后續(xù)的動(dòng)作,
僅針對(duì)可能包含結(jié)核菌的部分做處理,如此也能減少后續(xù)的處理時(shí)間。
接下來(lái)將介紹偵測(cè)結(jié)核菌所使用的色彩參數(shù)以及所使用的高斯混合模型(Gaussian Mixture Model, GMM)。

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