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另一個篩選的方法是在載體上放置一個合成基本代謝物(例如
氨基酸)的必需基因。如果導入載體的宿主是這種氨基酸的營養(yǎng)缺
陷株,載體就可以和宿主發(fā)生互補o。在沒有這種氨基酸的培養(yǎng)基
中,只有含有質粒的細胞能夠生長。因為合成缺陷因子的基因能夠
被整合到染色體上,或者因為親本染色體的回復突變,通常使用雙
缺陷型菌株來減少無質粒細胞取得生長優(yōu)勢的概率。
這兩種方法都有一個缺點,即使細胞丟失了質粒,無質粒細胞
在分裂數(shù)次后仍然保留有足夠的提供抗生素抗性或者生產營養(yǎng)缺陷
因子的基因產品。這樣,這些細胞將不能在選擇性平板上形成活菌
落(形成一個菌落需要繁殖約25代),但是在大規(guī)模系統(tǒng)中它們仍然
能夠存活并分裂繁殖。這些無質粒細胞消耗資源,卻不生產產品。
另一個相關的問題是,特別是在大規(guī)模系統(tǒng)中,含質粒細胞可
能保護無質粒細胞免受選擇性試劑的傷害。例如,含有質粒的營養(yǎng)
缺陷型細胞可能會分泌足夠的營養(yǎng)缺陷因子,以致無質粒細胞能夠
生長。對于抗生素,負責降解抗生素的酶可能被分泌到培養(yǎng)基中。
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