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本文標(biāo)題:"熒光蛋白嵌合體通常在N端或C端加入融合結(jié)構(gòu)"

新聞來源:未知 發(fā)布時間:2017-3-13 1:07:00 本站主頁地址:http://www.y7853.cn

熒光蛋白嵌合體通常在N端或C端加入融合結(jié)構(gòu)


程是相似的。熒光蛋白嵌合體通常在N端或C端加入融合結(jié)構(gòu)。2.
獲取目的蛋白N端或C端結(jié)構(gòu)一功能的知識將有助于避免干擾母體蛋
白的功能和/或
  定位。而且,了解每個末端表達(dá)定位的亞細(xì)胞環(huán)境對嵌合體的設(shè)
計將是有用的。例
  如,如果可能的話,避免把GFP加入到酸性蛋白水解環(huán)境中的蛋
白末端(如溶酶體
  內(nèi)腔),如果沒有相關(guān)知識,最初可制備N端和C端都連接GFP的嵌
合體。3a.末端插入連接子:如果N端和C端都包含決定目標(biāo)蛋白功
能和定位的結(jié)構(gòu)域,則
    在它和熒光蛋白之間插入短的連接肽以減少位阻的影響。3b.
包埋插入:也可以把熒光蛋白插入到分子的基本序列中,通常在未
結(jié)構(gòu)化的環(huán)形
    區(qū)域內(nèi)。如果其他方法失敗可考慮此種方法,但不能保證成功
。4.某些情況下,把編碼熒光蛋白的eDNA插入含有編碼目標(biāo)蛋白D
NA的質(zhì)粒更容易。
  此時,根據(jù)目標(biāo)蛋白是N端融合還是C端融合,應(yīng)格外注意熒光蛋
白的5’端和
  3’端。5.如果產(chǎn)生的是N端融合(指GFP連接到目標(biāo)蛋白的N端)
,貝Ⅱ必須合理設(shè)計GFP
  編碼區(qū)域的兩個末端。把Kozak序列和GFP翻譯起始密碼子結(jié)合起
來將會保證
  mRNA的高效翻譯,同時應(yīng)該刪除GFP的終止密碼子或者將其轉(zhuǎn)化
成編碼氨基酸。6.如果產(chǎn)生的是C端的融合,則刪除目標(biāo)蛋白的終
止密碼,或者將其轉(zhuǎn)化為一個編碼
  氨基酸;保存GFP的終止密碼子。7.另外也可以把編碼目標(biāo)蛋白
的cDNA插入到含有編碼熒光蛋白DNA的質(zhì)粒中。在
  很多情況下,這種方法更簡單,因為許多可以表達(dá)熒光蛋白的質(zhì)
粒可以買到。這些
  質(zhì)粒通常包含一個巨細(xì)胞病毒(CMV)連接的早期啟動子(在哺乳動
物細(xì)胞內(nèi)高效
  表達(dá)),一個包含了許多獨(dú)特的限制性核酸內(nèi)切酶識別位點的多
克隆位點(MCS)
  (促進(jìn)嵌合體的產(chǎn)生),一個可使質(zhì)粒在細(xì)菌種選擇性擴(kuò)增的具抗
生素抗性的區(qū)域,
  通常包括G418篩選基因。與上面所描述的熒光蛋白的插入一樣,
目標(biāo)蛋白插入到
  這些質(zhì)粒中也具有同樣的限制。8.如果產(chǎn)生的是C端融合,則把
目標(biāo)蛋白的eDNA插入到一個熒光蛋白編碼序列的5’
  端含有MCS的質(zhì)粒中。刪除目標(biāo)蛋白的終止密碼子,或者將其轉(zhuǎn)
化為一個編碼氨基
  酸,插入一個含有目標(biāo)蛋白翻譯密碼子的Kozak序列。9.如果產(chǎn)
生的是N端融合,則把目標(biāo)蛋白的eDNA插入到一個熒光蛋白編碼序
列3’端
  含有MCS的質(zhì)粒中(熒光蛋白編碼區(qū)的翻譯起始段含有Kozak序列)
。刪除熒光蛋

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