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本文標(biāo)題:"利用化石材料進(jìn)行DNA分析技術(shù)-化石顯微鏡"

新聞來源:未知 發(fā)布時(shí)間:2019-3-29 4:03:24 本站主頁地址:http://www.y7853.cn

利用化石材料進(jìn)行DNA分析技術(shù)-化石顯微鏡

   化石DNA的提取與甄別Edward M.G01enberg
    利用化石材料進(jìn)行DNA分析時(shí),研究范疇(而不是研究者本身)規(guī)定了研
究材料的性質(zhì)、保存時(shí)間和保存方式。上述任一因素都將影響實(shí)驗(yàn)的成敗
或者DNA保存的可能性。據(jù)報(bào)道,成功提取DNA的材料包括琥珀包埋物(Cano
 ef a/.,1992;DeSalle efa/.,1992;Poinar efa/.,1993)、植
物壓膜化石(Golenberg efa/.,1990;Soltis efa/.,1992)、哺乳動(dòng)
物糞便中的植物材料(Rogers&Bendich,1985)、干燥的蠟葉標(biāo)本(Rogers&B
endich,1985),以及考古發(fā)掘的殘留物,如空氣干燥的(Helentjaris,19
88)、炭化的(Helentjaris,1988;Horai efa/.,1991;Brown efa/.
,1994)甚至是水浸材料(Lawlor efa/.,1991)。需要指出的是,任何一
種上述材料都曾有很多從單個(gè)標(biāo)本中獲得可靠DNA失敗的報(bào)道(Sidow efa/
.,1991;Bailey ef a/.,1996;  H6ss e,a/.,1996 a,b;  Po
inar  ef a/.,1996;  Austin e,a/.,1997;  Yang efa/.,19
97b),這提示我們應(yīng)該用大量的樣本進(jìn)行研究,以增加成功的可能性。盡
管樣本的年代與保存下來的DNA片段的大小,以至DNA保存的可能性之間沒
有線性關(guān)系(陷筋o1989;Habelberg&Clegg,19915 Kelman&Moran,]996)
,但是迅速干燥年輕標(biāo)本比已水解的、非常老的標(biāo)本更能產(chǎn)生較穩(wěn)定的結(jié)
果。而且,有關(guān)古DNA的研究,目前的大部分工作集中在動(dòng)物標(biāo)本上,所以
對(duì)保存DNA的特性的了解主要來自于這些材料。然而,在動(dòng)物組織中,一般
情況下由于動(dòng)物自身存在的或者身體表面的細(xì)菌所產(chǎn)生酶的消化作用,DNA
的降解在動(dòng)物死亡后迅速發(fā)生;而在植物體內(nèi),伴隨著組織分解(葉片脫落
、種子傳播、枝葉斷裂),細(xì)胞的死亡并不很快發(fā)生,其內(nèi)部細(xì)菌的生長(zhǎng)也
相對(duì)較慢,因此,植物組織內(nèi)DNA降解的初始速率較慢�?偠灾参锏�
埋藏特性決定了其DNA具有較長(zhǎng)的保存時(shí)間。
    在這一章中,我將描述從陳舊的植物材料中提取DNA的一般方法,討論
在古DNA研究中我們應(yīng)該特別注意的方面,提出甄別古DNA序列的方法。29
.]  實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和提取技術(shù)
    從化石、亞化石或者蠟葉標(biāo)本中提取DNA與從現(xiàn)代新鮮材料中提取DNA
的技術(shù)基本一致(參見Sytsma,1994),但是進(jìn)行古DNA研究時(shí),我們需要特
別注意以下3個(gè)方面:污染物、抑制物、微量的降解DNA。要防止任何外源
的,無論是古代還是現(xiàn)代DNA的污染,設(shè)置防止外源DNA污染的對(duì)照實(shí)驗(yàn)尤
為重要。任何時(shí)候,所有用于提取DNA的工具和材料都應(yīng)該是一次性的,需
要重復(fù)使用的器具必須放在0.5%的次氯酸鈉溶液中浸泡幾個(gè)小時(shí),用蒸
餾水反復(fù)沖洗,然后放在短波紫外光下照射30分鐘。溶液必須首先分裝成
小體積,夠5—]o次提取即可,以防止剩余溶液所造成的隨機(jī)污染。如果條
件允許,應(yīng)

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